Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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