Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tnfrsf18O35714 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms