Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phox2bO35690 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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