Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms