Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms