Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna6O35345 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms