Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Ptpn9O35239 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ptpn9O35239 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ptpn9O35239 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ptpn9O35239 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ptpn9O35239 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ptpn9O35239 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ptpn9O35239 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ptpn9O35239 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ptpn9O35239 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ptpn9O35239 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn9O35239 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ptpn9O35239 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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