Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nedd9O35177 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nedd9O35177 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nedd9O35177 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nedd9O35177 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Nedd9O35177 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Nedd9O35177 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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