Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra2O08842 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms