Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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