Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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