Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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