Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms