Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm28038F7BCN9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm28038F7BCN9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm28038F7BCN9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm28038F7BCN9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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