Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa35E9QLQ1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa35E9QLQ1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa35E9QLQ1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa35E9QLQ1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa35E9QLQ1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms