Protein–RNA interactions for Protein: E9QAI8

Gm3460, Predicted gene 3460, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3460E9QAI8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm3460E9QAI8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm3460E9QAI8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm3460E9QAI8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3460E9QAI8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms