Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate1E9Q658 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms