Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms