Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms