Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms