Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa28D3Z1V9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms