Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms