Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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Trabd2bB1ATG9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Trabd2bB1ATG9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Trabd2bB1ATG9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Trabd2bB1ATG9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Trabd2bB1ATG9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Trabd2bB1ATG9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Trabd2bB1ATG9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Trabd2bB1ATG9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Trabd2bB1ATG9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Trabd2bB1ATG9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms