Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms