Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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