Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Rtf1A2AQ19 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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