Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms