Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc4a11A2AJN7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc4a11A2AJN7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms