Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms