Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5538W4VSP6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5538W4VSP6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5538W4VSP6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5538W4VSP6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5538W4VSP6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5538W4VSP6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms