Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Hdac5Q9Z2V6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Hdac5Q9Z2V6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Hdac5Q9Z2V6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Hdac5Q9Z2V6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Hdac5Q9Z2V6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Hdac5Q9Z2V6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Hdac5Q9Z2V6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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