Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stk39Q9Z1W9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms