Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cldn13Q9Z0S4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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