Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1a4Q9WV27 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms