Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn4Q9WU22 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ptpn4Q9WU22 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn4Q9WU22 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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