Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfwd2Q9R1A8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms