Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms