Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Npas3Q9QZQ0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Npas3Q9QZQ0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Npas3Q9QZQ0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Npas3Q9QZQ0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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