Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms