Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms