Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms