Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms