Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trp53inp1Q9QXE4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms