Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rai2Q9QVY8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms