Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hmgn5Q9JL35 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hmgn5Q9JL35 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hmgn5Q9JL35 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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