Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx5Q9JKQ4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms