Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms