Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms