Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms