Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pus3Q9JI38 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms